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蘇州百達(dá)生物科技有限公司

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)是在單個(gè)細(xì)胞水平上對(duì)基因組或者轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測(cè)序,從而分析相同表型細(xì)胞的遺傳異質(zhì)性,或獲得難以培養(yǎng)微生物的遺傳信息。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù),在這兩年得到了蓬勃發(fā)展。一些高通量的單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)開始為大家所熟知,其中以10X genomics單細(xì)胞測(cè)序平臺(tái)因?yàn)槌錾憩F(xiàn)最為大家接受。

10x Genomics最新的Chromium?系統(tǒng)利用油包水的微反應(yīng)體系,通過(guò)序列標(biāo)簽區(qū)別群體中的不同細(xì)胞,獲得單細(xì)胞水平的表達(dá)譜數(shù)據(jù),可實(shí)現(xiàn)數(shù)千甚至數(shù)萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞群體分析。該平臺(tái)通過(guò)油滴-barcode-單細(xì)胞的對(duì)應(yīng)關(guān)系,實(shí)現(xiàn)真正意義上的單細(xì)胞測(cè)序,單個(gè)樣本細(xì)胞檢測(cè)數(shù)最高可達(dá)1000-10000個(gè),其所建的文庫(kù)與Illumina各種型號(hào)的平臺(tái)高度兼容。

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)給抗體篩選帶來(lái)了重大變革。利用該技術(shù)可以從病人外周血淋巴細(xì)胞中獲得抗原特異性的單個(gè)記憶性B細(xì)胞,并針對(duì)單個(gè)細(xì)胞的抗體的重鏈 和輕鏈進(jìn)行RT-PCR,從而獲得人源的單克隆抗體。單個(gè)B細(xì)胞測(cè)序技術(shù)可以快速、高效地分離鑒定出抗原特異性的中和抗體,具有廣闊的應(yīng)用前景。

下圖展示了基于10X Chromium單細(xì)胞平臺(tái)進(jìn)行抗體VDJ基因序列建庫(kù)的流程圖。

目前,利用單個(gè)B細(xì)胞測(cè)序技術(shù)已經(jīng)篩選和鑒定出多種病毒的中和抗體。Scheid等利用FACS法從感染艾滋病毒的患者中分離到對(duì)HIV抗原有親和力的記憶性B細(xì)胞,并從中篩選到大量的HIV-1特異性的中和抗體。Tsioris等通過(guò)單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)從人B細(xì)胞中鑒定出針對(duì)西尼羅河病毒的中和抗體。Wang等[34]從中國(guó)寨卡康復(fù)病人體內(nèi)鑒定出高效、特異的寨卡病毒單克隆抗體。該抗體能在小鼠模型上有效治療寨卡病毒感染,有望成為治療寨卡病毒感染的候選藥物。類似地,Cox 等從人抗原特異性記憶B細(xì)胞中篩選到登革病毒的中和抗體。