抗體文庫是指采用聚合酶鏈反應(yīng)等手段在體外獲得成套抗體可變區(qū)輕重鏈基因，將這些基因重組入一定的載體，轉(zhuǎn)入適當(dāng)?shù)氖荏w細(xì)胞或噬菌體中，這些抗體基因克隆的集合體。從該文庫中能夠表達(dá)和篩選出所需的單克隆抗體。目前主要利用噬菌體展示篩選技術(shù)或酵母表面展示技術(shù)來對抗體文庫進(jìn)行表達(dá)和篩選。
基于高通量測序的抗體文庫測序能夠檢測原始合成的抗體文庫抗體基因組成及各自豐度，用于實驗前的QC工作。在進(jìn)行抗原篩選后，抗體文庫測序能夠發(fā)現(xiàn)與抗原高親和力結(jié)合的抗體序列，并用于下游優(yōu)化合成表達(dá)。
抗體文庫測序服務(wù)流程
以文庫DNA為起始材料，特異性擴(kuò)增BCR重鏈和輕鏈可變區(qū), 構(gòu)建測序文庫并進(jìn)行高通量測序。采用Illumina MiSeq 300PE平臺， 獲得完整的基因可變區(qū)；或采用PacBio三代測序獲得抗體轉(zhuǎn)錄本全長序列。
抗體文庫測序送樣要求
- DNA 樣品總量: ≥200 ng；菌體樣本：＞4ml（對數(shù)期）；
- 樣本物種包括：人，小鼠，豬，狗，駱駝等IMGI數(shù)據(jù)庫中已有參考抗體基因的物種。
抗體文庫測序周期和交付結(jié)果
- 交付周期：10-15個工作日；
- 測序數(shù)據(jù)量：重鏈輕鏈各自提供大約0.5-1百萬條測序讀長（0.5-1M)，全長三代測序提供5千-1萬條測序讀長序列；
- 交付結(jié)果：
- 基本數(shù)據(jù)QC及統(tǒng)計；
- 比對物種參考抗體基因序列庫并進(jìn)行統(tǒng)計分析；
- 克隆序列特征注釋： CDR1/2/3， FR1/2/3/4核酸序列，氨基酸序列注釋；
- 樣本克隆群體特征分析：CDR3序列長度分析，VDJ基因頻率統(tǒng)計及V-J基因組合頻率分析；
- 樣本間比較分析：測序飽和度分析，樣本間相關(guān)性分析等。
抗體文庫測序服務(wù)優(yōu)勢
- 全方位服務(wù)，提供從VDJ擴(kuò)增，建庫，測序和生信分析一站式服務(wù)；
- 采用準(zhǔn)確的擴(kuò)增引物體，全面提升可變區(qū)序列檢出；
- 豐富的分析內(nèi)容，提供可變區(qū)序列，抗體基因，多樣本比較等全方位分析服務(wù)；
- 合理的價格及快速的服務(wù)周期，幫助客戶提高生產(chǎn)效率。
