高通量測序技術(shù)（High-throughput sequencing）又稱“下一代”測序技術(shù)（”Next-generation” sequencing technology），以能一次并行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標(biāo)志。高通量測序是相對于傳統(tǒng)的桑格測序（Sanger Sequencing）而言的。目前高通量測序的主要平臺代表有羅氏公司(Roche)的454測序儀（Roch GS FLX sequencer），Illumina公司的Solexa基因組分析儀（Illumina Genome Analyzer）和ABI的SOLiD測序儀（ABI SOLiD sequencer）。

Illumina新一代測序（NGS）技術(shù)采用克隆擴增和邊合成邊測序（SBS）的測序化學(xué)技術(shù)，實現(xiàn)了快速、準(zhǔn)確的測序。該過程可在將DNA堿基整合到核酸鏈的同時對其進行識別。每個堿基在加入不斷延伸的鏈時會發(fā)出獨特的熒光信號，該信號可用于確定DNA序列的順序。

NGS技術(shù)能用于任何生物體的DNA測序，幾乎可為所有生物學(xué)問題提供有價值的信息。DNA測序是一項高度可擴展的技術(shù)，可通過多種方法應(yīng)用于小的目標(biāo)區(qū)域或整個基因組，讓研究人員能夠探究與任何生物的基因組、轉(zhuǎn)錄組或表觀基因組相關(guān)的幾乎所有問題。新一代測序（NGS）的主要區(qū)別在于DNA或RNA樣本的制備方法和使用的數(shù)據(jù)分析選項。

Miseq平臺

Illumina公司推出的MiSeq是一臺在單個儀器上整合了擴增、測序和數(shù)據(jù)分析的新一代測序儀。MiSeq有著革命性的流程和無可比擬的準(zhǔn)確性，這讓它成為快速且經(jīng)濟高效的DNA長片段測序的理想平臺，適合廣泛的應(yīng)用，已被FDA大量采購并即將通過FDA認(rèn)證。Miseq提供測序讀長達到2x300bp的高質(zhì)量測序模式, 非常適合抗體VDJ基因序列測序高通量測序。