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蘇州百達(dá)生物科技有限公司

免疫組庫(kù)測(cè)序

免疫組庫(kù)是指在任何指定時(shí)間,個(gè)體的循環(huán)系統(tǒng)內(nèi)所有功能多樣性B細(xì)胞和T細(xì)胞的總和,又可以細(xì)分為B細(xì)胞受體庫(kù)(B cell receptor Repertoire),T細(xì)胞受體庫(kù)(Tcell receptor Repertoire)。免疫組庫(kù)測(cè)序(Immune Repertoire sequencing(IR-SEQ))是以 B/T 淋巴細(xì)胞為研究目標(biāo),以多重PCR或5’RACE技術(shù)目的擴(kuò)增決定B細(xì)胞受體(BCR)或T細(xì)胞受體(TCR)多樣性的互補(bǔ)決定區(qū)(CDR區(qū)),再結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù)以及生物信息學(xué)手段,得到其可變區(qū)(VH),多變區(qū)(DH),結(jié)合區(qū)(JH)和恒定區(qū)(CH)的基因片段序列信息,全面評(píng)估免疫系統(tǒng)的多樣性變化,深入挖掘免疫組庫(kù)與疾病的關(guān)系。

我公司利用RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技術(shù)和公司特有的免疫組庫(kù)特異擴(kuò)增引物集進(jìn)行可變區(qū)的擴(kuò)增。通過(guò)利用Illumina Miseq測(cè)序平臺(tái),能夠低成本和短周期的完成序列測(cè)序工作,得到全面準(zhǔn)確的B/T淋巴細(xì)胞可變區(qū)組成及多樣性信息。當(dāng)前,我司提供人,小鼠,豬,狗,駱駝和兔物種的BCR免疫組測(cè)序,及人和小鼠的TCR免疫組庫(kù)測(cè)序。

免疫組庫(kù)測(cè)序服務(wù)流程

以RNA為起始材料,使用RACE法對(duì)BCR重鏈/輕鏈,TCR alpha/beta鏈分別構(gòu)建測(cè)序文庫(kù),然后采用Illumina MiSeq 300PE平臺(tái),獲得完整的基因可變區(qū)序列。

免疫組庫(kù)測(cè)序送樣要求

  • RNA 樣品總量: ≥2 μg;組織樣本(動(dòng)物):>300 mg;細(xì)胞樣本:>10萬(wàn)個(gè);
  • 提供樣本來(lái)源的種屬信息 。

免疫組庫(kù)測(cè)序周期和交付結(jié)果

  1. 交付周期:10-15個(gè)工作日;
  2. 測(cè)序數(shù)據(jù)量:重鏈輕鏈各自提供大約0.5-1百萬(wàn)條測(cè)序讀長(zhǎng)(0.5-1M);
  3. 交付結(jié)果:
    • 基本數(shù)據(jù)QC及統(tǒng)計(jì);
    • 比對(duì)物種參考抗體基因序列庫(kù)并進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析;
    • 克隆序列特征注釋?zhuān)?CDR1/2/3, FR1/2/3/4核酸序列,氨基酸序列注釋?zhuān)?/li>
    • 樣本克隆群體特征分析:CDR3序列長(zhǎng)度分析,VDJ基因頻率統(tǒng)計(jì)及V-J基因組合頻率分析;
    • 樣本間比較分析:測(cè)序飽和度分析,樣本間相關(guān)性分析等。

免疫組庫(kù)測(cè)序服務(wù)優(yōu)勢(shì)

  • 全方位服務(wù),提供從VDJ擴(kuò)增,建庫(kù),測(cè)序和生信分析一站式服務(wù);
  • 采用特有的5′ RACE擴(kuò)增技術(shù),及準(zhǔn)確的擴(kuò)增引物體,全面提升可變區(qū)序列檢出;
  • 采用分子標(biāo)簽(UMI)的擴(kuò)增技術(shù),降低因擴(kuò)增效率不同所引起的豐都差異;
  • 豐富的分析內(nèi)容,提供可變區(qū)序列,抗體基因,多樣本比較等全方位分析服務(wù);
  • 合理的價(jià)格及快速的服務(wù)周期,幫助客戶(hù)提高生產(chǎn)效率。