
單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-seq)技術(shù)測(cè)定單個(gè)細(xì)胞的全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá),有助于詳細(xì)了解細(xì)胞在復(fù)雜組織中如何發(fā)揮功能和相互作用。通過(guò)追蹤單個(gè)轉(zhuǎn)錄本的來(lái)源細(xì)胞,研究人員能夠在高度異質(zhì)的樣本中找出獨(dú)特的基因表達(dá)譜,最終揭示出其他方法經(jīng)常遺漏的稀有細(xì)胞類(lèi)型和動(dòng)態(tài)細(xì)胞狀態(tài)。例如,研究人員在利用批量細(xì)胞RNA-seq(測(cè)定大量細(xì)胞的基因表達(dá)平均值)分析一種致命的腫瘤時(shí),可能會(huì)漏掉一小部分對(duì)治療耐藥的細(xì)胞,從而忽略了潛在的藥物靶點(diǎn)。 10x Genomics平臺(tái)是單細(xì)胞研究領(lǐng)域公認(rèn)的引領(lǐng)者和金標(biāo)準(zhǔn),以10年經(jīng)驗(yàn)、2200多項(xiàng)專(zhuān)利幫助研究人員發(fā)表了8000多篇研究論文,目前是單細(xì)胞研究領(lǐng)域最主要的應(yīng)用平臺(tái)。
10x Genomics單細(xì)胞技術(shù)可以用于多種研究方向,主要包括免疫、腫瘤、病理分型、干細(xì)胞、發(fā)育生物學(xué)、細(xì)胞圖譜繪制等,具體表現(xiàn)在生物標(biāo)志物發(fā)掘、免疫表型分析、疾病通路研究、細(xì)胞類(lèi)型發(fā)現(xiàn)和組織器官表型增強(qiáng)等。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組研究:深入了解單個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式,研究細(xì)胞異質(zhì)性,并揭示細(xì)胞行為、機(jī)制及其與機(jī)體的關(guān)系。單細(xì)胞免疫組研究 :鑒定不同免疫細(xì)胞類(lèi)型,分析免疫細(xì)胞的表面蛋白表達(dá),了解免疫應(yīng)答機(jī)制。單細(xì)胞蛋白組研究 : 研究單細(xì)胞的蛋白表達(dá)模式,揭示細(xì)胞的蛋白質(zhì)調(diào)控機(jī)制。 單細(xì)胞表觀(guān)組研究 :研究單細(xì)胞的DNA甲基化和組蛋白修飾模式,了解表觀(guān)遺傳調(diào)控機(jī)制。

圖1. 10X Genomics技術(shù)原理示意圖
10x Genomics單細(xì)胞平臺(tái),通過(guò)微流控系統(tǒng)將單細(xì)胞快速分配到油包水的微反應(yīng)體系中,每個(gè)微反應(yīng)體系中的原始分子會(huì)獲得唯一的特異性分子標(biāo)簽(Barcode),制備生成的測(cè)序文庫(kù)可以在Illumina平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序,10x Genomics提供數(shù)據(jù)分析Cell Ranger及可視化軟件Loupe Browser,測(cè)序?qū)嶒?yàn)及分析流程可以和Illumina系統(tǒng)無(wú)縫銜接。 (圖1)
我們的經(jīng)驗(yàn)
物種 | 組織類(lèi)型 | 樣本個(gè)數(shù) | 示例 |
人 | 20 | 79 | 肺癌組織,結(jié)直腸癌組織,皮膚組織,淋巴轉(zhuǎn)移灶,骨髓懸液 |
恒河猴 | 12 | 17 | 腸道組織,肺組織,肝臟組織,腦組織,腎臟組織,心臟組織 |
小鼠 | 30 | 256 | 腸癌組織,肺組織,肝癌組織,海馬體組織,肌肉組織,軟骨,主動(dòng)脈組織,脂肪組織 |
大鼠 | 8 | 25 | 卵巢組織,皮膚組織,軟組織,心臟組織,腎臟組織 |
豬 | 9 | 20 | 皮膚組織,軟組織,心臟組織,腎臟組織 |
山羊 | 5 | 19 | 卵巢組織,皮膚組織,軟組織,心臟組織,腎臟組織 |
我們的優(yōu)勢(shì)
蘇州百達(dá)基于國(guó)內(nèi)資深單細(xì)胞研發(fā)團(tuán)隊(duì)和多種類(lèi)型樣本處理經(jīng)驗(yàn),為客戶(hù)提供高質(zhì)量,快速周期的10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序服務(wù)。
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