管理书籍排行榜,完美世界小说下载,yy玄幻小说排行榜完本 http://llwsb.cn 抗體基因測序,合成和表達一站式解決專家 Wed, 09 Apr 2025 06:44:46 +0000 zh-CN hourly 1 https://wordpress.org/?v=5.1.19 http://llwsb.cn/wp-content/uploads/2020/12/cropped-coin_antibody-1-32x32.png 抗體發(fā)現(xiàn) – 蘇州百達生物科技有限公司 http://llwsb.cn 32 32 抗體文庫測序 http://llwsb.cn/index.php/2021/02/12/antiobody-library-sequence/ Fri, 12 Feb 2021 14:35:26 +0000 http://129.28.170.61/?p=300 抗體文庫是指采用聚合酶鏈反應(yīng)等手段在體外獲得成套抗體可變區(qū)輕重鏈基因,將這些基因重組入一定的載體,轉(zhuǎn)入適當?shù)氖荏w細胞或噬菌體中,這些抗體基因克隆的集合體。從該文庫中能夠表達和篩選出所需的單克隆抗體。目前主要利用噬菌體展示篩選技術(shù)或酵母表面展示技術(shù)來對抗體文庫進行表達和篩選。

基于高通量測序的抗體文庫測序能夠檢測原始合成的抗體文庫抗體基因組成及各自豐度,用于實驗前的QC工作。在進行抗原篩選后,抗體文庫測序能夠發(fā)現(xiàn)與抗原高親和力結(jié)合的抗體序列,并用于下游優(yōu)化合成表達。

抗體文庫測序服務(wù)流程

以文庫DNA為起始材料,特異性擴增BCR重鏈和輕鏈可變區(qū), 構(gòu)建測序文庫并進行高通量測序。采用Illumina MiSeq 300PE平臺, 獲得完整的基因可變區(qū);或采用PacBio三代測序獲得抗體轉(zhuǎn)錄本全長序列。

抗體文庫測序送樣要求

  1. DNA 樣品總量: ≥200 ng;菌體樣本:>4ml(對數(shù)期);
  2. 樣本物種包括:人,小鼠,豬,狗,駱駝等IMGI數(shù)據(jù)庫中已有參考抗體基因的物種。

抗體文庫測序周期和交付結(jié)果

  • 交付周期:10-15個工作日;
  • 測序數(shù)據(jù)量:重鏈輕鏈各自提供大約0.5-1百萬條測序讀長(0.5-1M),全長三代測序提供5千-1萬條測序讀長序列;
  • 交付結(jié)果:
    1. 基本數(shù)據(jù)QC及統(tǒng)計;
    2. 比對物種參考抗體基因序列庫并進行統(tǒng)計分析;
    3. 克隆序列特征注釋: CDR1/2/3, FR1/2/3/4核酸序列,氨基酸序列注釋;
    4. 樣本克隆群體特征分析:CDR3序列長度分析,VDJ基因頻率統(tǒng)計及V-J基因組合頻率分析;
    5. 樣本間比較分析:測序飽和度分析,樣本間相關(guān)性分析等。

抗體文庫測序服務(wù)優(yōu)勢

  • 全方位服務(wù),提供從VDJ擴增,建庫,測序和生信分析一站式服務(wù);
  • 采用準確的擴增引物體,全面提升可變區(qū)序列檢出;
  • 豐富的分析內(nèi)容,提供可變區(qū)序列,抗體基因,多樣本比較等全方位分析服務(wù);
  • 合理的價格及快速的服務(wù)周期,幫助客戶提高生產(chǎn)效率。
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免疫組庫測序 http://llwsb.cn/index.php/2021/02/12/immunoseq/ Fri, 12 Feb 2021 14:03:58 +0000 http://129.28.170.61/?p=289 免疫組庫是指在任何指定時間,個體的循環(huán)系統(tǒng)內(nèi)所有功能多樣性B細胞和T細胞的總和,又可以細分為B細胞受體庫(B cell receptor Repertoire),T細胞受體庫(Tcell receptor Repertoire)。免疫組庫測序(Immune Repertoire sequencing(IR-SEQ))是以 B/T 淋巴細胞為研究目標,以多重PCR或5’RACE技術(shù)目的擴增決定B細胞受體(BCR)或T細胞受體(TCR)多樣性的互補決定區(qū)(CDR區(qū)),再結(jié)合高通量測序技術(shù)以及生物信息學(xué)手段,得到其可變區(qū)(VH),多變區(qū)(DH),結(jié)合區(qū)(JH)和恒定區(qū)(CH)的基因片段序列信息,全面評估免疫系統(tǒng)的多樣性變化,深入挖掘免疫組庫與疾病的關(guān)系。

我公司利用RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技術(shù)和公司特有的免疫組庫特異擴增引物集進行可變區(qū)的擴增。通過利用Illumina Miseq測序平臺,能夠低成本和短周期的完成序列測序工作,得到全面準確的B/T淋巴細胞可變區(qū)組成及多樣性信息。當前,我司提供人,小鼠,豬,狗,駱駝和兔物種的BCR免疫組測序,及人和小鼠的TCR免疫組庫測序。

免疫組庫測序服務(wù)流程

以RNA為起始材料,使用RACE法對BCR重鏈/輕鏈,TCR alpha/beta鏈分別構(gòu)建測序文庫,然后采用Illumina MiSeq 300PE平臺,獲得完整的基因可變區(qū)序列。

免疫組庫測序送樣要求

  • RNA 樣品總量: ≥2 μg;組織樣本(動物):>300 mg;細胞樣本:>10萬個;
  • 提供樣本來源的種屬信息 。

免疫組庫測序周期和交付結(jié)果

  1. 交付周期:10-15個工作日;
  2. 測序數(shù)據(jù)量:重鏈輕鏈各自提供大約0.5-1百萬條測序讀長(0.5-1M);
  3. 交付結(jié)果:
    • 基本數(shù)據(jù)QC及統(tǒng)計;
    • 比對物種參考抗體基因序列庫并進行統(tǒng)計分析;
    • 克隆序列特征注釋: CDR1/2/3, FR1/2/3/4核酸序列,氨基酸序列注釋;
    • 樣本克隆群體特征分析:CDR3序列長度分析,VDJ基因頻率統(tǒng)計及V-J基因組合頻率分析;
    • 樣本間比較分析:測序飽和度分析,樣本間相關(guān)性分析等。

免疫組庫測序服務(wù)優(yōu)勢

  • 全方位服務(wù),提供從VDJ擴增,建庫,測序和生信分析一站式服務(wù);
  • 采用特有的5′ RACE擴增技術(shù),及準確的擴增引物體,全面提升可變區(qū)序列檢出;
  • 采用分子標簽(UMI)的擴增技術(shù),降低因擴增效率不同所引起的豐都差異;
  • 豐富的分析內(nèi)容,提供可變區(qū)序列,抗體基因,多樣本比較等全方位分析服務(wù);
  • 合理的價格及快速的服務(wù)周期,幫助客戶提高生產(chǎn)效率。

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雜交瘤抗體基因測序 http://llwsb.cn/index.php/2020/04/23/hybridoma-miseq-sequence/ Thu, 23 Apr 2020 10:36:47 +0000 http://129.28.170.61/?p=1 雜交瘤細胞在保存過程中存在抗體基因丟失、細胞狀態(tài)不好影響抗體產(chǎn)生,甚至細胞死亡的情況,為將優(yōu)秀抗體長期保存、穩(wěn)定生產(chǎn),可將雜交瘤細胞中的抗體基因提取并測序,最終拿到核苷酸序列,并以 DNA 形式保存,用于后期外源表達及生產(chǎn)。雜交瘤細胞抗體測序所獲取的雜交瘤細胞單克隆抗體基因序列,是發(fā)表文章或?qū)@仨毿畔⒑椭亟M表達工程抗體的前提之一,同時也是抗體人源化工作的基礎(chǔ)。

我公司利用RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技術(shù)和公司特有的抗體特異引物集進行雜交瘤抗體基因測序。通過利用Illumina Miseq測序平臺,能夠低成本和短周期的完成序列測序工作,得到準確的抗體VDJ基因序列。

雜交瘤抗體基因測序服務(wù)流程


雜交瘤抗體基因測序送樣要求

  1. 提供數(shù)量>1×10^6經(jīng)Trizol處理的細胞,處理方法如下:
    • 將培養(yǎng)的細胞和上清進行吹打,細胞量不少于1×10^6,要活細胞且狀態(tài)良好;
    • 收到細胞,離心,棄上清留沉淀,根據(jù)細胞量加1-2ml Trizol (1×10^6加1mL,5×106-1×10^7加2mL,1×10^8加3mL),-80℃保存,準備提 RNA;
  2. 提供雜交瘤細胞種屬來源信息及抗體亞型信息;

雜交瘤抗體基因測序周期和交付結(jié)果

  1. 交付周期:3-5個工作日
  2. 交付內(nèi)容:
    • 100%準確的抗體重鏈及輕鏈VDJ全長氨基酸和核酸序列;
    • VDJ全長序列對應(yīng)的FR1/2/3/4, CDR1/2/3注釋信息;
    • Word及PDF版的分析報告,方便項目匯報和歸檔 ;

雜交瘤抗體基因測序服務(wù)優(yōu)勢

  1. 3-5個工作日急速交付測序結(jié)果,加速單克隆抗體基因序列發(fā)現(xiàn)和研究生產(chǎn)速度;
  2. 采用特有的5′ RACE擴增技術(shù),大大提升序列測序成功率,并能獲得單克隆基因的所有序列信息;
  3. 采用高通量測序方法可高效對抗體基因重輕鏈可變區(qū)序列進行測序;
  4. 經(jīng)驗豐富的引物設(shè)計及抗體基因分析能力;
  5. 多種屬(人,小鼠,大鼠,兔等)多亞型(IgG1, IgG2a, IgG2b, IgM 等)抗體均可進行基因提取;
  6. 可提供從雜交瘤抗體基因測序 — 抗體基因合成— 序列密碼子優(yōu)化 — 抗體蛋白表達— 抗體蛋白親和力驗證等整體服務(wù);
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